MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Buchnera aphidicola str. Ak (Acyrthosiphon kondoi) chromosome

Total Repeats: 21361

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017256	TAA	5	15	24	38	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017256	ATT	2	6	41	46	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017256	T	7	7	49	55	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017256	T	6	6	57	62	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017256	AAAGA	2	10	76	85	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017256	A	6	6	85	90	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017256	TCTT	2	8	93	100	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_017256	A	6	6	203	208	100 %	0 %	0 %	0 %	384227457
9	NC_017256	AGC	2	6	251	256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384227457
10	NC_017256	ATT	2	6	287	292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384227457
11	NC_017256	A	6	6	301	306	100 %	0 %	0 %	0 %	384227457
12	NC_017256	AGG	2	6	344	349	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384227457
13	NC_017256	GGT	2	6	390	395	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384227457
14	NC_017256	ATG	2	6	396	401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384227457
15	NC_017256	ATT	2	6	415	420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384227457
16	NC_017256	CTA	2	6	472	477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384227457
17	NC_017256	AGAT	2	8	488	495	50 %	25 %	25 %	0 %	384227457
18	NC_017256	CAA	3	9	528	536	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384227457
19	NC_017256	TTA	2	6	543	548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384227457
20	NC_017256	AGG	2	6	556	561	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384227457
21	NC_017256	GT	3	6	601	606	0 %	50 %	50 %	0 %	384227457
22	NC_017256	T	6	6	662	667	0 %	100 %	0 %	0 %	384227457
23	NC_017256	GGT	2	6	669	674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384227457
24	NC_017256	CTG	2	6	703	708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384227457
25	NC_017256	AGG	2	6	716	721	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384227457
26	NC_017256	TCT	2	6	726	731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384227457
27	NC_017256	ATTT	2	8	832	839	25 %	75 %	0 %	0 %	384227457
28	NC_017256	T	6	6	868	873	0 %	100 %	0 %	0 %	384227457
29	NC_017256	ATC	2	6	895	900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384227457
30	NC_017256	A	6	6	937	942	100 %	0 %	0 %	0 %	384227457
31	NC_017256	ATA	2	6	951	956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384227457
32	NC_017256	TAA	2	6	959	964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384227457
33	NC_017256	AT	3	6	981	986	50 %	50 %	0 %	0 %	384227457
34	NC_017256	T	6	6	992	997	0 %	100 %	0 %	0 %	384227457
35	NC_017256	AT	3	6	1110	1115	50 %	50 %	0 %	0 %	384227457
36	NC_017256	CAA	2	6	1152	1157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384227457
37	NC_017256	A	6	6	1156	1161	100 %	0 %	0 %	0 %	384227457
38	NC_017256	TAG	2	6	1162	1167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384227457
39	NC_017256	T	7	7	1229	1235	0 %	100 %	0 %	0 %	384227457
40	NC_017256	ATTA	2	8	1271	1278	50 %	50 %	0 %	0 %	384227457
41	NC_017256	T	6	6	1287	1292	0 %	100 %	0 %	0 %	384227457
42	NC_017256	GCT	2	6	1329	1334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384227457
43	NC_017256	GGTT	2	8	1389	1396	0 %	50 %	50 %	0 %	384227457
44	NC_017256	TA	3	6	1416	1421	50 %	50 %	0 %	0 %	384227457
45	NC_017256	GAT	2	6	1434	1439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384227457
46	NC_017256	TAC	2	6	1442	1447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384227457
47	NC_017256	AGA	2	6	1511	1516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384227457
48	NC_017256	A	7	7	1632	1638	100 %	0 %	0 %	0 %	384227457
49	NC_017256	CAT	2	6	1654	1659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384227457
50	NC_017256	TACA	2	8	1675	1682	50 %	25 %	0 %	25 %	384227457
51	NC_017256	ATT	2	6	1724	1729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384227457
52	NC_017256	GAC	2	6	1732	1737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384227457
53	NC_017256	AAAAT	2	10	1819	1828	80 %	20 %	0 %	0 %	384227457
54	NC_017256	AGA	2	6	1859	1864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384227457
55	NC_017256	A	6	6	1880	1885	100 %	0 %	0 %	0 %	384227457
56	NC_017256	ATC	2	6	1901	1906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384227457
57	NC_017256	TCT	2	6	1938	1943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384227457
58	NC_017256	GCT	2	6	2019	2024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384227457
59	NC_017256	TTA	2	6	2034	2039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384227457
60	NC_017256	A	7	7	2048	2054	100 %	0 %	0 %	0 %	384227457
61	NC_017256	T	6	6	2069	2074	0 %	100 %	0 %	0 %	384227457
62	NC_017256	TA	3	6	2079	2084	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017256	ATT	2	6	2085	2090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017256	T	7	7	2112	2118	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017256	ATA	2	6	2119	2124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017256	AAAATT	2	12	2129	2140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017256	ATA	2	6	2164	2169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017256	T	8	8	2170	2177	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017256	ATA	2	6	2184	2189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017256	T	8	8	2220	2227	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017256	T	6	6	2239	2244	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017256	A	7	7	2253	2259	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017256	AT	3	6	2306	2311	50 %	50 %	0 %	0 %	384227458
74	NC_017256	TCA	2	6	2315	2320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384227458
75	NC_017256	AGAT	2	8	2335	2342	50 %	25 %	25 %	0 %	384227458
76	NC_017256	ATT	2	6	2358	2363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384227458
77	NC_017256	TCT	2	6	2379	2384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384227458
78	NC_017256	AAT	2	6	2411	2416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384227458
79	NC_017256	T	6	6	2416	2421	0 %	100 %	0 %	0 %	384227458
80	NC_017256	T	9	9	2438	2446	0 %	100 %	0 %	0 %	384227458
81	NC_017256	T	6	6	2452	2457	0 %	100 %	0 %	0 %	384227458
82	NC_017256	GAA	2	6	2467	2472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384227458
83	NC_017256	AATT	2	8	2515	2522	50 %	50 %	0 %	0 %	384227458
84	NC_017256	GTAT	2	8	2551	2558	25 %	50 %	25 %	0 %	384227458
85	NC_017256	TTTG	2	8	2601	2608	0 %	75 %	25 %	0 %	384227458
86	NC_017256	T	7	7	2611	2617	0 %	100 %	0 %	0 %	384227458
87	NC_017256	GATT	2	8	2642	2649	25 %	50 %	25 %	0 %	384227458
88	NC_017256	T	7	7	2648	2654	0 %	100 %	0 %	0 %	384227458
89	NC_017256	CTG	2	6	2707	2712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384227458
90	NC_017256	ATATTA	2	12	2713	2724	50 %	50 %	0 %	0 %	384227458
91	NC_017256	GT	3	6	2743	2748	0 %	50 %	50 %	0 %	384227458
92	NC_017256	T	6	6	2795	2800	0 %	100 %	0 %	0 %	384227458
93	NC_017256	ACTT	2	8	2807	2814	25 %	50 %	0 %	25 %	384227458
94	NC_017256	CTT	2	6	2874	2879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384227458
95	NC_017256	TTTTA	2	10	2939	2948	20 %	80 %	0 %	0 %	384227458
96	NC_017256	TGG	2	6	2967	2972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384227458
97	NC_017256	T	6	6	2981	2986	0 %	100 %	0 %	0 %	384227458
98	NC_017256	TAA	2	6	3016	3021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384227458
99	NC_017256	TTTTAT	2	12	3035	3046	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384227458
100	NC_017256	T	8	8	3111	3118	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017256	GATTG	2	10	3182	3191	20 %	40 %	40 %	0 %	384227459
102	NC_017256	AGC	2	6	3203	3208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384227459
103	NC_017256	ATCGGT	2	12	3210	3221	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384227459
104	NC_017256	GGT	2	6	3228	3233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384227459
105	NC_017256	GGAG	2	8	3242	3249	25 %	0 %	75 %	0 %	384227459
106	NC_017256	TTA	2	6	3276	3281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384227459
107	NC_017256	T	6	6	3291	3296	0 %	100 %	0 %	0 %	384227459
108	NC_017256	GTT	2	6	3297	3302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384227459
109	NC_017256	TAGGTT	2	12	3337	3348	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384227459
110	NC_017256	TA	3	6	3349	3354	50 %	50 %	0 %	0 %	384227459
111	NC_017256	T	7	7	3375	3381	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017256	T	6	6	3389	3394	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017256	T	6	6	3404	3409	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017256	AT	3	6	3416	3421	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017256	T	6	6	3452	3457	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017256	ATT	2	6	3500	3505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017256	ATTT	2	8	3544	3551	25 %	75 %	0 %	0 %	384227460
118	NC_017256	TTTG	2	8	3554	3561	0 %	75 %	25 %	0 %	384227460
119	NC_017256	AT	3	6	3574	3579	50 %	50 %	0 %	0 %	384227460
120	NC_017256	CCT	2	6	3584	3589	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384227460
121	NC_017256	ATT	2	6	3590	3595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384227460
122	NC_017256	CAGA	2	8	3610	3617	50 %	0 %	25 %	25 %	384227460
123	NC_017256	TAAT	2	8	3636	3643	50 %	50 %	0 %	0 %	384227460
124	NC_017256	A	7	7	3646	3652	100 %	0 %	0 %	0 %	384227460
125	NC_017256	A	7	7	3680	3686	100 %	0 %	0 %	0 %	384227460
126	NC_017256	CAAA	2	8	3709	3716	75 %	0 %	0 %	25 %	384227460
127	NC_017256	GAA	2	6	3767	3772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384227460
128	NC_017256	AAGA	2	8	3775	3782	75 %	0 %	25 %	0 %	384227460
129	NC_017256	A	6	6	3801	3806	100 %	0 %	0 %	0 %	384227460
130	NC_017256	TGAAAT	2	12	3826	3837	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384227460
131	NC_017256	GTA	2	6	3875	3880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384227460
132	NC_017256	A	6	6	3903	3908	100 %	0 %	0 %	0 %	384227460
133	NC_017256	TTA	2	6	3909	3914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384227460
134	NC_017256	A	8	8	3914	3921	100 %	0 %	0 %	0 %	384227460
135	NC_017256	GAT	2	6	3932	3937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384227460
136	NC_017256	TTA	2	6	3947	3952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384227460
137	NC_017256	A	7	7	3982	3988	100 %	0 %	0 %	0 %	384227460
138	NC_017256	TTA	2	6	4091	4096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384227461
139	NC_017256	AAT	2	6	4098	4103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384227461
140	NC_017256	A	7	7	4114	4120	100 %	0 %	0 %	0 %	384227461
141	NC_017256	T	6	6	4128	4133	0 %	100 %	0 %	0 %	384227461
142	NC_017256	GTG	2	6	4184	4189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384227461
143	NC_017256	TAAT	2	8	4193	4200	50 %	50 %	0 %	0 %	384227461
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